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北京同仁医院以医院综合医疗为主体，北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所为附属科研机构，形成 “一院三所”发展格局，成为集医疗、教学、科研、预防、国际交流五位一体的医疗科研联合体。眼科、耳鼻咽喉科为国家临床重点学科，变态反应(鼻过敏)科为国家临床重点专科，中医眼科学为中医重点学科。
北京同仁医院拥有教育部重点实验室1个，工信部重点实验室1个，北京市重点实验室5个;工程研究中心1个，省部级工程研究中心4个;省部级国家科技合作基地2个，北京实验室1个。医院是全国防盲技术指导组和防聋治聋技术指导组组长单位，设有世界卫生组织防盲合作中心和世界卫生组织防聋合作中心，作为国际眼库协会会员单位，设有北京同仁眼库。
研究方向：高度近视及其眼底并发症的临床研究。在国内率先开展了后巩膜加固手术联合玻璃体切割手术治 疗高度近视黄斑劈裂。十年接诊高度近视患者万例，手术治 疗三千余例。目前采用联合手术气体填充使高度近视黄斑劈裂视网膜脱离的一次性手术成功率达到了94.6%，多次应邀在全国眼科学术会议上发言。
玻璃体视网膜疾病的临床工作是眼底病专业的核心工作方向和职责所在。年门诊量近19万人次，年手术量1.4万人次，高难度3-4级手术占比>97%。北京同仁医院眼底科在糖尿病视网膜病变、年龄相关性黄斑变性、视网膜静脉阻塞、视网膜脱离、脉络膜黑色素瘤等各类眼底疾病的诊疗方面具有丰富的经验。